Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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