Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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PTPRBP23467 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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PTPRBP23467 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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PTPRBP23467 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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PTPRBP23467 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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PTPRBP23467 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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