Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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