Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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