Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms