Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms