Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 FTX-215ENST00000638681 9771 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 ABCC2-202ENST00000370449 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
LAMA3Q16787 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms