Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TAF1AQ15573 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms