Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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