Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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