| RUNX3 | Q13761 | PMCHL1-201 | ENST00000418902 | 1917 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.32 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PLS1-211 | ENST00000497002 | 2258 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.32 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TIPARP-205 | ENST00000486483 | 2150 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CCDC102B-201 | ENST00000360242 | 2711 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | R3HCC1L-205 | ENST00000612478 | 3337 nt | TSL 5 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004803.1-201 | ENST00000503602 | 3207 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTGFR-203 | ENST00000370758 | 4337 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL133268.1-201 | ENST00000405676 | 1401 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SMC2-AS1-201 | ENST00000603487 | 7020 nt | TSL 2 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PRUNE2-208 | ENST00000443509 | 12356 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCAT14-202 | ENST00000627127 | 3935 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA62.3-201 | ENST00000365110 | 153 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | S100A10-201 | ENST00000368809 | 616 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MLIP-203 | ENST00000370877 | 1234 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DPRX-201 | ENST00000376650 | 648 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SPRR2A-201 | ENST00000392653 | 709 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYCSP19-201 | ENST00000411715 | 316 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC234781.4-201 | ENST00000419384 | 244 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01821-201 | ENST00000419786 | 1084 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EIF4A1P1-201 | ENST00000420241 | 934 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAR1P1-201 | ENST00000427163 | 934 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO1P45-201 | ENST00000431457 | 267 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL022310.1-201 | ENST00000436974 | 690 nt | TSL 2 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00446-202 | ENST00000438327 | 357 nt | TSL 3 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS29P7-201 | ENST00000439662 | 171 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL691517.1-201 | ENST00000440833 | 1235 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND6P5-201 | ENST00000448266 | 512 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RAB28P3-201 | ENST00000448325 | 597 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND5P8-201 | ENST00000449817 | 1083 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC002553.2-201 | ENST00000453217 | 340 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005304.1-201 | ENST00000457609 | 405 nt | TSL 3 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004692.2-202 | ENST00000458680 | 478 nt | TSL 3 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC108751.2-201 | ENST00000469993 | 231 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC123768.1-201 | ENST00000486285 | 432 nt | TSL 3 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PLAC8-205 | ENST00000509973 | 489 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC078906.1-201 | ENST00000523602 | 798 nt | TSL 3 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC136475.4-201 | ENST00000534271 | 280 nt | TSL 5 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PRH1-206 | ENST00000543626 | 710 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC074029.2-201 | ENST00000551045 | 634 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL358913.1-201 | ENST00000554342 | 121 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL049835.1-201 | ENST00000555850 | 514 nt | TSL 3 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL121839.1-201 | ENST00000556233 | 1185 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FRMD6-AS2-202 | ENST00000557625 | 581 nt | TSL 4 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009039.1-201 | ENST00000568711 | 471 nt | TSL 4 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL703P-201 | ENST00000578485 | 302 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005244.2-201 | ENST00000585228 | 718 nt | TSL 3 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC14A2-AS1-203 | ENST00000592286 | 528 nt | TSL 4 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00907-211 | ENST00000601948 | 795 nt | TSL 5 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005034.4-201 | ENST00000603612 | 899 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099669.2-201 | ENST00000616549 | 437 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR548A1HG-201 | ENST00000636739 | 558 nt | TSL 4 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BX088723.1-201 | ENST00000637785 | 708 nt | TSL 5 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR8B1P-202 | ENST00000641132 | 1178 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC000374.1-201 | ENST00000434698 | 1745 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM169A-203 | ENST00000510496 | 5810 nt | TSL 5 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TUG1-201 | ENST00000519077 | 5673 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EXO1-208 | ENST00000518483 | 2899 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EIF2S1-202 | ENST00000466499 | 2390 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GABPB1-AS1-202 | ENST00000499624 | 16182 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAN1-202 | ENST00000561594 | 2738 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CHD9-221 | ENST00000615216 | 10603 nt | TSL 5 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR5B12-202 | ENST00000641921 | 1807 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC38A9-218 | ENST00000512595 | 1756 nt | TSL 2 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADAM29-201 | ENST00000359240 | 3325 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | N4BP2L2-202 | ENST00000357505 | 2917 nt | TSL 2 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | WDR63-203 | ENST00000370596 | 2905 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | APC-207 | ENST00000508376 | 10619 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CDR1-201 | ENST00000370532 | 2467 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BX664718.1-201 | ENST00000439824 | 3224 nt | TSL 2 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OBSCN-214 | ENST00000636875 | 23907 nt | TSL 5 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | THOC1-221 | ENST00000631280 | 2011 nt | TSL 5 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR8D1-201 | ENST00000357821 | 1026 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.110-201 | ENST00000363220 | 99 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SAMD13-204 | ENST00000370671 | 724 nt | TSL 3 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD66.1-201 | ENST00000391230 | 76 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VDAC2P1-201 | ENST00000399358 | 958 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL158837.1-201 | ENST00000417644 | 452 nt | TSL 2 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012506.4-201 | ENST00000421563 | 541 nt | TSL 4 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC115285.1-201 | ENST00000424879 | 736 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL031599.1-201 | ENST00000432694 | 808 nt | TSL 3 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL031584.1-201 | ENST00000447169 | 754 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL31P20-201 | ENST00000449593 | 360 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | THOC7-AS1-201 | ENST00000468961 | 673 nt | TSL 2 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC146944.2-203 | ENST00000502493 | 354 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01455-201 | ENST00000503167 | 561 nt | TSL 4 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | THAP6-209 | ENST00000507556 | 1134 nt | TSL 2 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PGBD4P4-201 | ENST00000509673 | 613 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC139495.1-202 | ENST00000513164 | 354 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RFPL4AP3-201 | ENST00000515267 | 345 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LSM3P2-201 | ENST00000551246 | 273 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009803.1-201 | ENST00000551531 | 416 nt | TSL 3 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NDUFB1-204 | ENST00000555441 | 458 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007014.1-201 | ENST00000572828 | 610 nt | TSL 3 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CCDC58P3-201 | ENST00000590792 | 430 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011503.1-202 | ENST00000598914 | 919 nt | TSL 2 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL606490.9-201 | ENST00000603331 | 271 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL451086.1-201 | ENST00000605596 | 223 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC38A2-214 | ENST00000612232 | 1221 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00216-201 | ENST00000623548 | 1126 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092162.3-201 | ENST00000624511 | 1624 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |