Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
NEUROD1Q13562 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms