Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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ITGB3BPQ13352 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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ITGB3BPQ13352 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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ITGB3BPQ13352 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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ITGB3BPQ13352 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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ITGB3BPQ13352 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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ITGB3BPQ13352 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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