Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms