Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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HOXA13P31271 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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