Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010542.3-202ENST00000561728 701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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