Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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