Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDCD1Q15116 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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