Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms