Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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