Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms