Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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HOXD10P28358 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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HOXD10P28358 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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HOXD10P28358 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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HOXD10P28358 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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HOXD10P28358 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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HOXD10P28358 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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