Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUX2O14529 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUX2O14529 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUX2O14529 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CUX2O14529 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CUX2O14529 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUX2O14529 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUX2O14529 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CUX2O14529 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUX2O14529 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CUX2O14529 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUX2O14529 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUX2O14529 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUX2O14529 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CUX2O14529 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUX2O14529 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUX2O14529 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUX2O14529 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUX2O14529 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUX2O14529 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUX2O14529 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUX2O14529 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUX2O14529 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUX2O14529 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUX2O14529 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUX2O14529 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUX2O14529 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUX2O14529 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUX2O14529 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUX2O14529 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUX2O14529 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CUX2O14529 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CUX2O14529 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUX2O14529 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUX2O14529 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUX2O14529 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUX2O14529 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUX2O14529 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUX2O14529 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUX2O14529 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CUX2O14529 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUX2O14529 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUX2O14529 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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