Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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USP18Q9UMW8 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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USP18Q9UMW8 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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USP18Q9UMW8 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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USP18Q9UMW8 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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USP18Q9UMW8 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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USP18Q9UMW8 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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USP18Q9UMW8 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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USP18Q9UMW8 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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USP18Q9UMW8 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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