Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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ZNF548Q8NEK5 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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ZNF548Q8NEK5 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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ZNF548Q8NEK5 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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