Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCAQ16586 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCAQ16586 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCAQ16586 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCAQ16586 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCAQ16586 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCAQ16586 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCAQ16586 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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SGCAQ16586 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCAQ16586 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCAQ16586 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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SGCAQ16586 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCAQ16586 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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SGCAQ16586 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCAQ16586 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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SGCAQ16586 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCAQ16586 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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SGCAQ16586 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCAQ16586 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCAQ16586 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCAQ16586 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCAQ16586 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCAQ16586 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
SGCAQ16586 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCAQ16586 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCAQ16586 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCAQ16586 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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SGCAQ16586 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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SGCAQ16586 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCAQ16586 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCAQ16586 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCAQ16586 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCAQ16586 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCAQ16586 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCAQ16586 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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SGCAQ16586 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCAQ16586 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCAQ16586 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCAQ16586 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCAQ16586 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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