Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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SYCP1Q15431 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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SYCP1Q15431 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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SYCP1Q15431 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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SYCP1Q15431 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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SYCP1Q15431 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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SYCP1Q15431 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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SYCP1Q15431 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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