Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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