Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF2H3Q13889 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158 ms