Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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TOP3AQ13472 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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