Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms