Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms