Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRGP23470 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms