Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC099314.1-201ENST00000563916 562 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC091304.1-202ENST00000568624 3100 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF40O75150 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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RNF40O75150 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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RNF40O75150 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 ZNF385D-AS2-202ENST00000448980 370 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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