Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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