Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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CCDC142Q17RM4 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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CCDC142Q17RM4 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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CCDC142Q17RM4 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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CCDC142Q17RM4 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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CCDC142Q17RM4 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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CCDC142Q17RM4 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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CCDC142Q17RM4 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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CCDC142Q17RM4 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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CCDC142Q17RM4 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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