Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SS18Q15532 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms