Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms