Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms