Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTP4A2Q12974 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms