Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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HOXD13P35453 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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HOXD13P35453 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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HOXD13P35453 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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HOXD13P35453 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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HOXD13P35453 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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HOXD13P35453 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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HOXD13P35453 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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HOXD13P35453 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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