Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms