Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 FASLG-202ENST00000367721 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 GRIK1-AS1-202ENST00000412579 818 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 CUZD1-206ENST00000392790 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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HOXA2O43364 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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HOXA2O43364 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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HOXA2O43364 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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HOXA2O43364 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
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