Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 PLPPR1-202ENST00000395056 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TTC26-210ENST00000495038 1599 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 OR5E1P-201ENST00000305754 927 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 IGFL3-201ENST00000341415 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP145-201ENST00000363124 125 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SNORA5C-201ENST00000364902 137 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 PAGE5-203ENST00000374955 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MIR555-201ENST00000384987 96 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP185-201ENST00000390963 114 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MRO-202ENST00000398439 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC004986.1-201ENST00000414855 607 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 BX664727.2-201ENST00000420308 228 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC098828.1-201ENST00000436164 440 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RPL21P88-201ENST00000436649 436 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AP000350.3-201ENST00000440099 289 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC01713-201ENST00000445589 932 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL139237.1-201ENST00000446107 513 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC008592.1-201ENST00000503091 665 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC233724.8-201ENST00000504574 234 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC083902.1-201ENST00000508578 359 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC233724.3-201ENST00000512613 128 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC109588.1-202ENST00000515720 880 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC123788.1-201ENST00000526922 783 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC02489-201ENST00000527239 354 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC060814.3-201ENST00000557717 460 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 APOOP5-202ENST00000564761 566 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 DNM1P33-201ENST00000565222 270 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC100791.1-201ENST00000570408 324 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RN7SL122P-201ENST00000579362 301 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AP005328.1-202ENST00000580781 776 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CR848007.3-201ENST00000615762 228 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 uc_338.24-201ENST00000617802 182 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL513478.1-201ENST00000621265 228 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MIR3191-201ENST00000636300 76 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TEAD1-207ENST00000638666 1281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.9 ms