Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms