Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL1Q13616 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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