Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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