Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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FOXQ1Q9C009 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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FOXQ1Q9C009 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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