Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms