Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BHLHA9Q7RTU4 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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