Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 PSD3-203ENST00000428502 6330 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 FAM186A-201ENST00000327337 7127 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LAMA3Q16787 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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